Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r67G5E8C1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r67G5E8C1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms