Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf148G3X9R7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rnf148G3X9R7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms