Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ercc6F8VPZ5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ercc6F8VPZ5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ercc6F8VPZ5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms