Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres1F6ZIS7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres1F6ZIS7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms