Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20538F6Z9R1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms