Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sptbn5F6UCX4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn5F6UCX4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms