Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5407E9Q7Q1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5407E9Q7Q1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5407E9Q7Q1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5407E9Q7Q1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5407E9Q7Q1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm5407E9Q7Q1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm5407E9Q7Q1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm5407E9Q7Q1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5407E9Q7Q1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5407E9Q7Q1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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