Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20518E9Q548 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20518E9Q548 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms