Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930579F01RikE9Q3L6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930579F01RikE9Q3L6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms