Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Cfap46E9Q2C0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cfap46E9Q2C0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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