Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrp3E9Q1T6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp3E9Q1T6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms