Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r68E9Q0V3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r68E9Q0V3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms