Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfta2E9PXB6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sfta2E9PXB6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms