Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc175E9PVB3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc175E9PVB3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms