Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim5E9PV98 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim5E9PV98 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms