Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prrt2E9PUL5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prrt2E9PUL5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms