Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms