Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc78D3Z5T1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc78D3Z5T1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms