Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calhm1D3Z291 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calhm1D3Z291 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms