Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17333C6EQI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms