Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CatipB9EKE5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CatipB9EKE5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms