Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pnldc1B2RXZ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pnldc1B2RXZ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms