Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H60cB1B213 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H60cB1B213 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H60cB1B213 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H60cB1B213 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms