Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp36B1AQJ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp36B1AQJ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms