Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm11127A7VMS2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11127A7VMS2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11127A7VMS2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11127A7VMS2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11127A7VMS2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11127A7VMS2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm11127A7VMS2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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