Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930435E12RikA6X8Z9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms