Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pm20d2A3KG59 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms