Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Atp8b5A3FIN4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Atp8b5A3FIN4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Atp8b5A3FIN4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Atp8b5A3FIN4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms