Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palm3A2TJV2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palm3A2TJV2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms