Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl41A2AUC9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klhl41A2AUC9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms