Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fbxo47A2A6H3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms