Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Prdm16-202ENSMUST00000070313 8429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Lig3-211ENSMUST00000173722 5797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Csmd1Q923L3 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms