Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms