Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Olfr161-202ENSMUST00000216259 7133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC8.59□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC8.59□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprmP28828 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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