Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Pde6aP27664 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Pde6aP27664 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Pde6aP27664 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Pde6aP27664 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Pde6aP27664 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Pde6aP27664 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Pde6aP27664 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Pde6aP27664 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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