Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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