Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr319-201ENSMUST00000076965 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm10683-201ENSMUST00000211556 1374 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Tnf-202ENSMUST00000167924 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Slc15a5-206ENSMUST00000171804 2461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Nt5c1b-202ENSMUST00000118657 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Acvr1-204ENSMUST00000112601 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rtn4Q99P72 Gm42654-201ENSMUST00000200789 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rtn4Q99P72 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rtn4Q99P72 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rtn4Q99P72 Gsdma2-202ENSMUST00000093938 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Atp2c1-212ENSMUST00000176770 2781 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rtn4Q99P72 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Olfr214-205ENSMUST00000217313 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Gm4451-201ENSMUST00000186000 1891 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rtn4Q99P72 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms