Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd10P28359 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms