Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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