Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Vpreb2P13373 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms