Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M5A7VMS3 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
H2-M5A7VMS3 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms