Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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OtofQ9ESF1 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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