Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccer1Q9CQL2 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccer1Q9CQL2 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccer1Q9CQL2 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccer1Q9CQL2 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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