Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Cdhr2-201ENSMUST00000037145 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ablim1-205ENSMUST00000111526 2164 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Vmn1r40-204ENSMUST00000228485 2689 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Rprd1b-201ENSMUST00000029180 4283 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Plppr1-201ENSMUST00000076670 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gucy2d-201ENSMUST00000098274 3537 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm38236-201ENSMUST00000192661 3229 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm36949-201ENSMUST00000192487 2327 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ctse-202ENSMUST00000112411 1837 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Cd22-201ENSMUST00000019248 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gpr61-201ENSMUST00000062028 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Mrpl15-206ENSMUST00000156816 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Polr2l-201ENSMUST00000043870 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pgm2-202ENSMUST00000102783 2523 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Sec23a-204ENSMUST00000165134 2529 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Nr6a1-201ENSMUST00000076275 5941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Erg-204ENSMUST00000118113 3062 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm12117-201ENSMUST00000183831 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm36398-201ENSMUST00000192255 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm30312-201ENSMUST00000194516 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms