Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Brpf1B2RRD7 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Brpf1B2RRD7 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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