Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RxraP28700 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RxraP28700 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RxraP28700 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RxraP28700 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RxraP28700 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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