Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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