Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms