Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
OtofQ9ESF1 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
OtofQ9ESF1 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
OtofQ9ESF1 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
OtofQ9ESF1 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
OtofQ9ESF1 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
OtofQ9ESF1 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
OtofQ9ESF1 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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