Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NacadQ5SWP3 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms